Dies ist eine Sammlung von häufig gestellten Fragen zu den Segmentierten Inneren Organen des Visible Human (SIO).
1 Ist dies das gleiche Modell wie der Visible Human?
Nein, aber es basiert darauf. Die von der U.S. National Library of Medicine veröffentlichten Original-Farbbilder des männlichen Visible Human wurden verkleinert und geometrisch an die CT-Bilder angeglichen, um ein isotropes, multispektrales Bildvolumen zu erhalten. In einem anschließenden Segmentationsverfahren wurden die anatomischen Bestandteile identifiziert und mit Objektmarken versehen.
2 Wie erhalte ich das Modell?
Das Modell ist kostenlos erhältlich, erfordert aber aus rechtlichen Gründen einen unterschriebenen Lizenzvertrag. Bitte folgen Sie den Anweisungen auf der Seite Segmentierte Innere Organe.
3 Kann ich die Daten vorher ansehen?
Sicher, bitte laden Sie die Beispieldatei herunter. Dieses ZIP-Archiv enthält einen Satz von 5 aufeinanderfolgenden Schnitten mit jeweils den jeweiligen Farb-, CT- und Labelbildern. Eine Objektliste ist ebenfalls enthalten, die die Zahlen in den Labelbildern mit ihrer anatomischen Bedeutung verknüpft.
4 Wie hoch ist die Auflösung des Modells?
Der begrenzende Faktor ist der Voxelabstand, der durch eine Voxelgröße von 1 mm x 1 mm x 1 mm gegeben ist. Kleinere Strukturen erscheinen nur als geringfügige Veränderungen der Farbe oder der CT-Intensität.
5 Wie genau ist die Segmentierung?
Die Segmentierung erfolgte mit einem fortschrittlichen 3D-Algorithmus, der auf den Farben der verschiedenen Organe basiert, der im Allgemeinen die Objektgrenzen sehr genau lokalisieren konnte (siehe Referenzen).
Der Anatomieatlas Voxel-Man 3D-Navigator: Innere Organe, die auf diesem Modell basiert, wurde von mehreren unabhängigen Anatomen und Radiologen positiv bewertet.
6 Enthält das Modell die Muskeln?
Ja, das Modell beinhaltet fast das gesamte Muskelgewebe des Rumpfes. Es wird jedoch meist als „nicht klassifizierte Muskeln“ bezeichnet, nur wenige Muskeln der Bauchregion werden explizit bezeichnet. Bitte schauen Sie sich die Objektliste an.
7 Enthält dieses Modell alle Teile des Anatomieatlas der Inneren Organe?
Fast, aber einige sehr dünne Arterien und Nerven des Anatomieatlas Voxel-Man 3D-Navigator: Innere Organe, die auf den Querschnittsbildern nicht sichtbar sind, wurden mit einem Röhreneditor modelliert und als polygonale Oberflächenstrukturen dargestellt. Sie sind nicht Teil dieses Modells.
8 Wie ist das Labelvolumen organisiert?
Genau wie die Farb- und CT-Daten besteht das Labelvolumen aus einem Stapel nummerierter Schnittbilder. Farb-, CT- und Label-Bilder mit derselben Bildnummer stellen unterschiedliche Eigenschaften derselben Voxel dar.
Anstelle von Farben oder Intensitätswerten enthält ein Labelbild numerische Objektmarken. Jedes Objekt wird durch mindestens eine Objektnummer dargestellt (z.B. aufsteigende Aorta 511, Aortenbogen 512, absteigende Aorta 513, Bauchaorta 514). Überall, wo Sie eine Objektnummer finden, liegt das entsprechende Objekt vor. Eine vollständige Auflistung der Objektnummern finden Sie in der Objektliste.
9 Warum ist auf den Labelbildern nichts zu sehen?
Dies sind 16-Bit-TIFF-Bilder, die von einigen Programmen nicht richtig dargestellt werden. Zu den Programmen, die mit diesen Daten umgehen können, gehören unter anderem ImageJ (kostenlos) und Photoshop. Wenn das Bild immer noch schwarz erscheint, passen Sie die Einstellungen für Helligkeit/Kontrast bzw. Pegel/Fenster an.
10 Wie kann ich aus diesen Bildern einen Volumendatensatz erstellen?
Die Bilder müssen übereinander gestapelt werden. Verwenden Sie beispielsweise in ImageJ Datei > Import > Image Sequence…, um Image-Volumes für Farb-, CT- und Labeldaten zu erstellen.
11 Ist dies ein polygonales Oberflächenmodell?
Nein, die Daten werden als 3D-Voxelmodell geliefert. Wenn Sie ein Oberflächenmodell benötigen, können Sie es mit Methoden wie Marching Cubes selbst erstellen.
12 Kann ich das Modell als 3DS, 3MF, Collada, OBJ, STL, VRML, X3D-Datei erhalten?
Dies sind Dateiformate für Computer Aided Design, 3D-Grafik oder 3D-Druck, siehe vorherige Frage.
13 Kann ich die Segmentationssoftware bekommen?
Die interaktive Segmentation, die wir für alle unsere virtuellen 3D-Modelle verwenden, ist im Simulatormodul Voxel-Man My Cases implementiert. Beachten Sie jedoch, dass diese Version für radiologische Bilder optimiert ist und den RGB-Klassifikator nicht enthält.
14 Das klingt mir viel zu technisch. Wie kann ich dieses Modell zum Studium der Anatomie verwenden?
Laden Sie den Voxel-Man 3D-Navigator: Innere Organe Atlas der Anatomie und Radiologie herunter, der unter einer Creative Commons-Lizenz frei verfügbar ist.
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